Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C11orf49Q9H6J7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms