Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BHLHE41Q9C0J9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms