Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SGIP1Q9BQI5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGIP1Q9BQI5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms