Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS6KC1Q96S38 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms