Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNBD2Q96M20 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms