Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPNS2Q96L46 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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