Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC35A4Q96G79 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms