Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG2BQ96BY7 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms