Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TTC21AQ8NDW8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TTC21AQ8NDW8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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