Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NANOGP8Q6NSW7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms