Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LDLRAP1Q5SW96 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms