Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FREM1Q5H8C1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FREM1Q5H8C1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FREM1Q5H8C1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FREM1Q5H8C1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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