Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TDRD12Q587J7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TDRD12Q587J7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms