Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC92Q53HC0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms