Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPHKAPQ2M3C7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPHKAPQ2M3C7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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