Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ISXQ2M1V0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms