Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CA9Q16790 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CA9Q16790 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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CA9Q16790 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CA9Q16790 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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