Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHRNA6Q15825 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CHRNA6Q15825 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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