Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TAF11Q15544 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TAF11Q15544 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms