Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNTN1Q12860 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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