Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ST3GAL4Q11206 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms