Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TGM3Q08188 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TGM3Q08188 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms