Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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H3F3AP84243 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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H3F3AP84243 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H3F3AP84243 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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