Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUP107P57740 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms