Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms