Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMARCA2P51531 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms