Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PIK3CBP42338 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIK3CBP42338 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms