Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA3P42263 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms