Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDM5CP41229 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDM5CP41229 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms