Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ETFBP38117 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETFBP38117 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms