Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LTBRP36941 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LTBRP36941 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LTBRP36941 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LTBRP36941 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms