Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD13P35453 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms