Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP6P35125 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP6P35125 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP6P35125 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP6P35125 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP6P35125 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms