Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPC1P35052 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GPC1P35052 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms