Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CEACAM1P13688 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms