Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMC1P11047 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms