Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PKHD1P08F94 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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