Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POP4O95707 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POP4O95707 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POP4O95707 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POP4O95707 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
POP4O95707 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
POP4O95707 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POP4O95707 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms