Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAPGEF3O95398 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEF3O95398 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms