Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PPFIA3O75145 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PPFIA3O75145 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms