Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFS4O43181 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NDUFS4O43181 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NDUFS4O43181 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NDUFS4O43181 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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NDUFS4O43181 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NDUFS4O43181 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFS4O43181 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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