Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TO15178 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TO15178 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TO15178 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms