Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLGNO14967 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CLGNO14967 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms