Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PHOX2AO14813 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PHOX2AO14813 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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