Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC01387J3KSC0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC01387J3KSC0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms