Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPIPB9F8W1W9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPIPB9F8W1W9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms