Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms