Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A8MVJ9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A8MVJ9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
A8MVJ9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms