Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms