Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms